中西医协同“旗舰”医院建设试点项目是国家积极促进中医药传承创新、加快中医药特色发展的重要举措，2022年，浙江省立同德医院入选国家中西医协同旗舰医院试点项目建设单位。浙江省立同德医院（浙江省中医药研究院、浙江省精神卫生中心）是浙江省卫生健康委直属的三级甲等全国重点中西医结合医院。医院“一体两翼、一院五区”，占地660亩，拥有翠苑院区（中西医结合诊疗中心）、闲林院区（浙江省精神卫生诊疗与培训）、天目山路院区（中医药国际交流）、之江院区（中西医结合特色诊疗）、青山湖院区（中医药研究与产业化）五大院区，核定床位2100张，开放床位2300张。

医院拥有中药药用资源研究中心、中西医结合肿瘤研究所、中西医结合肾病研究所等10个研究所室；拥有国家中医药管理局三级实验室、省部级重点实验室等11个重点实验室；还拥有科技部国家中药现代化科技产业基地、博士后科研工作站、省中药新药研究中心、省级工程研究中心等。

医院先后研制开发了黄芪生脉饮、胃复春、养胃颗粒、生血宁、肝血宝、血障平、慢支固本颗粒、清胃黄连片等20余种国家新药。“精制蝮蛇、五步蛇、银环蛇抗毒血清”获 全国科学大会奖（1978）；“蚕砂提取物研制中药II类新药生血宁片”获国家科技进步奖二等奖（2004）；“中药光敏剂诊治恶性肿瘤研究”获全国中医药科技进步一等奖（1992）。

医院建立首席临床科学家制度，推动临床科研一体化建设，建设六大重点专科——中西医结合肿瘤科、中西医结合精神卫生科、中西医结合肾病科、中西医结合消化科、中西医结合骨伤科、中西医结合妇科。打造中西医急性和疑难重症康复训练为一体的康复中心，建立多元化特色化中医治未病服务中心，推进浙江省“中医处方一件事”；构建完备中药药事前端、过程、后续质控体系，实现中药全程可溯源管理；以青山湖科创园区中药制剂中心为依托，为浙江全省提供中药制剂研究、开发应用平台。坚持临床导向，围绕重大疑难疾病和优势病种的临床诊疗，开展医学前沿技术和临床转化应用研究，在肿瘤、消化、精神卫生、肾病、骨伤、妇科等重点专科领域形成一批中西医结合诊疗新技术、新方法、新标准、新模式；注重临床与转化，打造高能级临床研究和成果转化推广平台，全面提升中西医结合临床科研水平。